宋莲生(张国立 饰)乃一江湖郎中，浪荡不羁医术高明，在长沙行医时巧遇绣庄庄主无双，被她深深吸引，因此在绣庄门前开起了门诊，并应允无双的要求援助东林党购买大批伤药，违反了朝廷划定而面临极刑，因为九芝堂老板的奇策，宋莲生得以获救，后来又是以事与混混齐大头(李耕 饰)树敌，急救了闻世堂力所不及的病人，此堂名声大跌又遭仇视，更因为误会无双而分开长沙，地在途中发明当地闹瘟疫，疫算将舒展至长沙，他立时返回通知九芝堂大批购药，并掌握药材发卖，瘟疫得以掌握，圣上欲赐堂号给建功的药房，闻世堂吴老太医的侄女如月(邓婕 饰)使出坏招，令九芝堂名声受损。逢九芝堂药材欠缺，无双患沉痾，宋莲生没法 只得问闻世堂乞助，如月又行使计策令宋莲生被逐出长沙，无双亦带着支离破碎的心前往南京……宋莲生生性仁慈、好仗义执言，却在长沙被迫几度离返，可谓世事难料，人心叵测。
